Kasthurirathne SN, Mamlin B, Grieve G, Biondich P: Towards Standardized Patient Data Exchange: Integrating a FHIR Based API for the Open Medical Record System. Health Technology and Informatics, 216, 932, 2015.
抄録
相互運用性は、臨床情報システムの臨機応変な実装と最新の医療の分散された性質によって引き起こされる制限に対処するために不可欠である。 HL7 V2およびV3標準は、医療の相互運用性を確保する上で重要な役割を果たしてきた。 FHIRは、HL7 V2およびV3の基本的な制限に対処するために作成された次世代標準である。 FHIRは、新興国で広く使用されているオープンソース医療記録システムであるOpenMRSに特に関連している。 FHIRは、OpenMRSがオーダメードのAPIから標準ベースのAPIに移行する可能性を秘めています。 OpenMRSプラットフォーム用のFHIRベースのAPIを設計し実装するための取り組みについて説明する。この取り組みから学んだ教訓は、従来のOpenMRS APIからFHIRベースのAPIに移行するための長期的な計画を定義するために使用され、開発者の学習曲線を大幅に削減し、標準への遵守が強化される。
2017年6月1日木曜日
An HL7-FHIR-based Object Model for a Home-Centered Data Warehouse for Ambient Assisted Living Environments
Schwartze J, Jansen L, Schrom H, Wolf KH, Haux R, Marschollek M: An HL7-FHIR-based Object Model for a Home-Centered Data Warehouse for Ambient Assisted Living Environments. Studies in Health Technology and Informatics, 216, 1060, 2015.
抄録
現在のAAL（Ambient Assisted Living: 高齢者支援）環境は、個別の技術を持つ1人の人を支援することに重点を置いている。建物のエネルギー管理や住宅産業サービスなどの家庭環境におけるサブドメイン間の相互運用性はない。 BASIS（スケーラブルでインテリジェントなシステムによるビルオートメーション）は、すべてのセンサーとアクチュエータを単一の効率的な家庭用バスに統合することを目的としている。最初のステップでは、意味的に豊富なデータウェアハウスオブジェクトモデルを作成する。我々は、FHIRを選択し、主にObservation、Device and Locationのリソースに基づいて、AALの外部サブドメインが必要とするマイナーな拡張を伴うオブジェクトモデルを構築した。 FHIRは非常に柔軟で、他の家庭関連のサブドメインでは完全であることが判明しました。オブジェクトモデルは、BASISのすべての構造および手続きデータを格納する分離されたソフトウェアパーティションに実装されている。
抄録
現在のAAL（Ambient Assisted Living: 高齢者支援）環境は、個別の技術を持つ1人の人を支援することに重点を置いている。建物のエネルギー管理や住宅産業サービスなどの家庭環境におけるサブドメイン間の相互運用性はない。 BASIS（スケーラブルでインテリジェントなシステムによるビルオートメーション）は、すべてのセンサーとアクチュエータを単一の効率的な家庭用バスに統合することを目的としている。最初のステップでは、意味的に豊富なデータウェアハウスオブジェクトモデルを作成する。我々は、FHIRを選択し、主にObservation、Device and Locationのリソースに基づいて、AALの外部サブドメインが必要とするマイナーな拡張を伴うオブジェクトモデルを構築した。 FHIRは非常に柔軟で、他の家庭関連のサブドメインでは完全であることが判明しました。オブジェクトモデルは、BASISのすべての構造および手続きデータを格納する分離されたソフトウェアパーティションに実装されている。
Standard Information Models for Representing Adverse Sensitivity Information in Clinical Documents.
Topaz M, Seger DL, Goss F, Lai K, Slight SP, Lau JJ, Nandigam H, Zhou L: Standard Information Models for Representing Adverse Sensitivity Information in Clinical Documents. Methods of Information in Medicine, 55(2), 151-157, 2016.
抄録
バックグラウンド：
有害な感受性（例えば、アレルギーおよび不耐性）情報は、任意の電子健康記録システムの重要な要素である。有害な機密情報の構造化された入力のためのいくつかの標準が存在するが、多くの臨床家はこのデータをフリーテキストとして記録する。
目的：
本研究では、1）既存の共通の有害感受性情報モデルを同定し、比較し、2）入院患者および外来患者の有害感受性臨床ノートの一部に関するアレルギー情報を表すための有害感受性情報モデルのcoverageを評価することを目的とした。
方法：
我々は、4つの一般的な有害感受性情報モデルを比較した：HL7アレルギーおよび不耐性ドメイン分析モデル、HL7-DAM; the Fast Healthcare Interoperability Resources,、FHIR; ケア文書の統合継続性、C-CDA、入院患者および外来患者（n = 120）のコーパス上でそのcoverageを評価した。
結果：
我々は、アレルギー専門医の経過ノートは、経過ノートごとに有害感受性属性の頻度が最も高く、救急部門の経過ノートは最も少ない属性を有することを見出した。全体として、モデルは、経過ノートに含まれる有害感受性情報の75％〜95％をカバーする中央属性において多くの類似点を有していた。しかし、いくつかのアトリビュート（特にバリューセット）の表現はモデル間でうまく一致しておらず、データの相互運用性を達成する上で障害となる可能性がある。また、情報モデル間で有害感受性の例外はよく表されていなかった。
結論：
一般的な有害感受性モデルが臨床上の注意の関連情報のかなりの部分をカバーしていることが判明したが、我々の結果はデータ相互運用性の標準間での調整が必要であることを強く示していた。
抄録
バックグラウンド：
有害な感受性（例えば、アレルギーおよび不耐性）情報は、任意の電子健康記録システムの重要な要素である。有害な機密情報の構造化された入力のためのいくつかの標準が存在するが、多くの臨床家はこのデータをフリーテキストとして記録する。
目的：
本研究では、1）既存の共通の有害感受性情報モデルを同定し、比較し、2）入院患者および外来患者の有害感受性臨床ノートの一部に関するアレルギー情報を表すための有害感受性情報モデルのcoverageを評価することを目的とした。
方法：
我々は、4つの一般的な有害感受性情報モデルを比較した：HL7アレルギーおよび不耐性ドメイン分析モデル、HL7-DAM; the Fast Healthcare Interoperability Resources,、FHIR; ケア文書の統合継続性、C-CDA、入院患者および外来患者（n = 120）のコーパス上でそのcoverageを評価した。
結果：
我々は、アレルギー専門医の経過ノートは、経過ノートごとに有害感受性属性の頻度が最も高く、救急部門の経過ノートは最も少ない属性を有することを見出した。全体として、モデルは、経過ノートに含まれる有害感受性情報の75％〜95％をカバーする中央属性において多くの類似点を有していた。しかし、いくつかのアトリビュート（特にバリューセット）の表現はモデル間でうまく一致しておらず、データの相互運用性を達成する上で障害となる可能性がある。また、情報モデル間で有害感受性の例外はよく表されていなかった。
結論：
一般的な有害感受性モデルが臨床上の注意の関連情報のかなりの部分をカバーしていることが判明したが、我々の結果はデータ相互運用性の標準間での調整が必要であることを強く示していた。
Bridging the Gap between HL7 CDA and HL7 FHIR: A JSON Based Mapping
Rinner C, Duftschmid G: Bridging the Gap between HL7 CDA and HL7 FHIR: A JSON Based Mapping. Studies in Health Technology and Informatics, 223, 100-106, 2016.
抄録
オーストリアの電子健康記録（EHR）システムELGAは、2016年12月に公開された。これは、文書指向のEHRシステムであり、HL7 Clinical Document Architecture（CDA）に基づいている。 HL7 Fast Healthcare Interoperability Resources（FHIR）は、HL7メッセージとCDAドキュメントの利点を組み合わせた比較的新しい標準である。 ELGAに格納された情報へのアクセスを容易にするために、CDA文書をFHIR資源にマッピングするための適合FHIRリソースに基づく方法を提示する。オープンソースのFHIRフレームワークであるHAPI-FHIRと公開されているFHIRサーバーを使用して、Javaを使用した概念実証ツールを作成し、提示されたマッピングを評価しました。他のアプローチとは対照的に、マッピングファイルがFHIR仕様によく似ているので、既存のFHIRインフラストラクチャを再利用することがでる。情報過多を減らし、CDA文書へのアクセスを容易にするために、FHIRは、オーストリアの細粒度ベースでCDAデータを照会する標準化された方法を提供することができた。
抄録
オーストリアの電子健康記録（EHR）システムELGAは、2016年12月に公開された。これは、文書指向のEHRシステムであり、HL7 Clinical Document Architecture（CDA）に基づいている。 HL7 Fast Healthcare Interoperability Resources（FHIR）は、HL7メッセージとCDAドキュメントの利点を組み合わせた比較的新しい標準である。 ELGAに格納された情報へのアクセスを容易にするために、CDA文書をFHIR資源にマッピングするための適合FHIRリソースに基づく方法を提示する。オープンソースのFHIRフレームワークであるHAPI-FHIRと公開されているFHIRサーバーを使用して、Javaを使用した概念実証ツールを作成し、提示されたマッピングを評価しました。他のアプローチとは対照的に、マッピングファイルがFHIR仕様によく似ているので、既存のFHIRインフラストラクチャを再利用することがでる。情報過多を減らし、CDA文書へのアクセスを容易にするために、FHIRは、オーストリアの細粒度ベースでCDAデータを照会する標準化された方法を提供することができた。
SMART-on-FHIR implemented over i2b2
Wagholikar KB, Mandel JC, Klann JG, Wattanasin N, Mendis M, Chute CG, Mandl KD, Murphy SN: SMART-on-FHIR implemented over i2b2. Journal of the American Medical Informatics Association, 24(2), 398-402, 2017.
抄録
我々は、SMART-on-FHIRセルと呼ばれる、FHIR（Fast Healthcare Interoperability Resources）形式の生物学とベッドサイド（i2b2）を統合したリポジトリから患者情報を提供するためのインタフェースを開発した。セルは、患者ごとにFHIRリソースを提供し、クライアントアプリケーションを認証するための「代替可能なモジュラーサードパーティ製アプリケーション（SMART）OAuth2」仕様をサポートする。これは、認証、REST、i2b2からFHIRへのコンバータ、リソースの強化、クエリエンジン、およびキャッシュの6つのモジュールで構成されるi2b2サーバープラグインとして実装されている。ソースコードはオープンソースとして自由に入手できる。 i2b2に格納されている患者データにアクセスするセルからSMARTアプリを起動できることを実証し、テストi2b2インストールからリソースにアクセスしてセルをテストした。我々は、テスト患者の基本情報、投薬、検査、診断を首尾よく検索できた。 SMART-on-FHIRセルにより、i2b2サイトはFHIR形式で簡素化された安全なデータアクセスを提供できるようになり、革新性と相互運用性が向上する。さらに、i2b2をアプリプラットフォームに変えることができる。
抄録
我々は、SMART-on-FHIRセルと呼ばれる、FHIR（Fast Healthcare Interoperability Resources）形式の生物学とベッドサイド（i2b2）を統合したリポジトリから患者情報を提供するためのインタフェースを開発した。セルは、患者ごとにFHIRリソースを提供し、クライアントアプリケーションを認証するための「代替可能なモジュラーサードパーティ製アプリケーション（SMART）OAuth2」仕様をサポートする。これは、認証、REST、i2b2からFHIRへのコンバータ、リソースの強化、クエリエンジン、およびキャッシュの6つのモジュールで構成されるi2b2サーバープラグインとして実装されている。ソースコードはオープンソースとして自由に入手できる。 i2b2に格納されている患者データにアクセスするセルからSMARTアプリを起動できることを実証し、テストi2b2インストールからリソースにアクセスしてセルをテストした。我々は、テスト患者の基本情報、投薬、検査、診断を首尾よく検索できた。 SMART-on-FHIRセルにより、i2b2サイトはFHIR形式で簡素化された安全なデータアクセスを提供できるようになり、革新性と相互運用性が向上する。さらに、i2b2をアプリプラットフォームに変えることができる。
Combining Archetypes with Fast Health Interoperability Resources in Future-proof Health Information Systems
Bosca D, Moner D, Maldonado JA, Robles M: Combining Archetypes with Fast Health Interoperability Resources in Future-proof Health Information Systems. Studies in Health Technology and Informatics, 210, 180-184, 2015.
抄録
メッセージング標準、特にHL7 v2は、ヘルス情報システムの通信と相互運用性のために頻繁に使用されている。 HL7 FHIRは、意味論的相互運用性を実現するためのメッセージング標準の進化として作成された。 FHIRは、両者が臨床情報の正確なモデリングに基づいているので、デュアルモデル方法論のような他のアプローチと幾分類似している。本稿では、FHIRのような標準にデュアルモデル手法を適用する方法を示す。我々は、FHIRとHL7 CDA、EN ISO 13606、およびopenEHRなどの他の仕様との間のデータ変換に対するこのアプローチの有用性を示す。また、FHIRにアーキタイプを定義する利点と欠点、そしてこのアプローチの結果と成果についても議論する。最後に、FHIRリソースとアーキタイプの両方をサポートするテストデータサーバーを作成することで、このアプローチの例を示す。
抄録
メッセージング標準、特にHL7 v2は、ヘルス情報システムの通信と相互運用性のために頻繁に使用されている。 HL7 FHIRは、意味論的相互運用性を実現するためのメッセージング標準の進化として作成された。 FHIRは、両者が臨床情報の正確なモデリングに基づいているので、デュアルモデル方法論のような他のアプローチと幾分類似している。本稿では、FHIRのような標準にデュアルモデル手法を適用する方法を示す。我々は、FHIRとHL7 CDA、EN ISO 13606、およびopenEHRなどの他の仕様との間のデータ変換に対するこのアプローチの有用性を示す。また、FHIRにアーキタイプを定義する利点と欠点、そしてこのアプローチの結果と成果についても議論する。最後に、FHIRリソースとアーキタイプの両方をサポートするテストデータサーバーを作成することで、このアプローチの例を示す。
C3-PRO Connecting ResearchKit to the Health System Using i2b2 and FHIR
Pfiffner PB, Pinyol I, Natter MD, Mandl KD: C3-PRO Connecting ResearchKit to the Health System Using i2b2 and FHIR. PLoS One, 11(3), 2016.
抄録
ヘルスケア分野における消費者情報技術の巨人による新たな関心は、スマートフォンを個人の健康データ記憶装置に変換することに焦点を当てている。オープンソースのResearchKitが導入されたことにより、Appleは研究者に対して、彼らの研究対象者にインフォームドコンセントを行い、分散した集団から個人の健康データと患者に関して報告されたアウトカム（PRO）を容易に収集するためのフレームワークを提供した。しかし、ResearchKitは、研究の背景を知らなけいため、データ転送機能を提供せず、アプリをヘルスシステムから切り離している。個人の健康データとPROは、ヘルスシステムデータの文脈に沿って提示されるときに最も価値のあるものである。私たちの目標は、パーソナルヘルスとPROデータを140の学術医療センターで広く採用されているオープンソースプラットフォームに簡単かつ安全に統合できるツールチェーンを構築することである。 我々はC3-PRO（Consent, Contact, Communicationの枠組み）を提示する。このオープンソースのツールチェインは、標準に準拠した方法で、ResearchKitアプリケーションを幅広く使用されている臨床研究インフラストラクチャ、生物学とベッドサイド（i2b2）の統合に関するインフォマティクスに接続する。 C3-PROは新興の健康データ標準Fast Healthcare Interoperability Resources（FHIR）を活用している。
抄録
ヘルスケア分野における消費者情報技術の巨人による新たな関心は、スマートフォンを個人の健康データ記憶装置に変換することに焦点を当てている。オープンソースのResearchKitが導入されたことにより、Appleは研究者に対して、彼らの研究対象者にインフォームドコンセントを行い、分散した集団から個人の健康データと患者に関して報告されたアウトカム（PRO）を容易に収集するためのフレームワークを提供した。しかし、ResearchKitは、研究の背景を知らなけいため、データ転送機能を提供せず、アプリをヘルスシステムから切り離している。個人の健康データとPROは、ヘルスシステムデータの文脈に沿って提示されるときに最も価値のあるものである。私たちの目標は、パーソナルヘルスとPROデータを140の学術医療センターで広く採用されているオープンソースプラットフォームに簡単かつ安全に統合できるツールチェーンを構築することである。 我々はC3-PRO（Consent, Contact, Communicationの枠組み）を提示する。このオープンソースのツールチェインは、標準に準拠した方法で、ResearchKitアプリケーションを幅広く使用されている臨床研究インフラストラクチャ、生物学とベッドサイド（i2b2）の統合に関するインフォマティクスに接続する。 C3-PROは新興の健康データ標準Fast Healthcare Interoperability Resources（FHIR）を活用している。
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